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甲基化芯片数据分析
    表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活。甲基化芯片可以检测全基因组范围内的甲基化位点,研究启动子甲基化对基因调控的影响。

    数据分析流程如下。

数据预处理(数据校正)
相关性和重现率分析
处理组-对照组相关性评估
甲基化/非甲基化位点统计检验(fisher、pearson和卡方检验等统计学方法)
样本组间的甲基化趋势差异分析
样本组间的甲基化聚类分析
基于甲基化谱构建疾病预测,诊断预测模型
差异化甲基化位点相关上下游基因的信号通路与生物途径分析
差异化甲基化位点相关上下游基因的生物功能本体注释
DNA甲基化趋势与基因表达调控的关联分析
DNA甲基化差异位点邻近启动子区调控motif的识别
DNA甲基化趋势在TTS邻近区域的分布特征
DNA甲基化趋势在基因组染色体上的整体分布特征
根据客户需要提供的个性化分析

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