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  • cGMP寡核酸生产
    cGMP寡核酸生产

    生产基地简介

    • 自2004年成立十年来,锐博生物始终专注于核酸生产,拥有数十人组成的专业的技术和生产团队,包括拥有20年核酸生产经验的药物化学博士,核酸药物分析博士,5年以上cGMP药物生产管理经验的项目负责人员和QA负责人。
    质量研究技术服务

    质量研究技术服务

    • 锐博生物cGMP寡核酸生产基地配备核酸专用分析与鉴定设备,包括:通量二维液-质谱检测系统, Waters超高压液相分析系统(UPLC),Thermo Fisher Quantum Ultra,Agilent ICP-MS,Agilent GC-MS,Waters 四级杆飞行时间质谱(Q-TOF)等尖端检测设备。
    稳定性研究

    稳定性研究

    • 对寡核酸原料药进行稳定性研究是设计适当的制剂处方及对其制订必要的稳定性措施的基础,是处方前研究的重要组成部分.
    cMPG寡核酸生产行业资讯

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    • 报道国内外核酸研究领域前沿进展,深入解析研究方案和实验技术
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    降解组测序数据分析

        在植物体内绝大多数的miRNA是利用剪切作用调控靶基因的表达,且剪切常发生在miRNA与mRNA互补区域的第十位核苷酸上。靶基因经剪切产生二个片段,5" 剪切片段和3" 剪切片段。其中3" 剪切片段,包含有自由的5" 单磷酸和3" polyA尾巴,可被RNA连接酶连接,连接产物可用于下游高通量测序。而含有5" 帽子结构的完整基因,含有帽子结构的5" 剪切片段或是其他缺少5" 单磷酸基团的RNA是无法被RNA连接酶连接,因而无法进入下一步的测序实验。对测序数据进行深入地比对分析,可以直观地发现在mRNA序列的某个位点会出现一个波峰,而该处正是候选的miRNA剪切位点。利用降解组测序,可以真正从实验中找到miRNA的作用靶基因。传统预测miRNA靶标的方式主要是依靠计算机模拟后进行验证,假阳性的发生率极高。随着高通量测序的发展,直接测序得到mRNA的降解片段,通过后续的信息分析,不仅能够准确分析小RNA及靶基因,还能发现新的小RNA。

     


    图1 植物降解组测序原理

    服务流程

    数据分析

            在植物体内绝大多数的miRNA是利用剪切作用调控靶基因的表达,且剪切常发生在miRNA与mRNA互补区域的第十位核苷酸上。靶基因经剪切产生二个片段,5"剪切片段和3"剪切片段。其中3"剪切片段,包含有自由的5"单磷酸和3"polyA尾巴,可被RNA连接酶连接,连接产物可用于下游高通量测序;而含有5"帽子结构的完整基因,含有帽子结构的5"剪切片段或是其他缺少5"单磷酸基团的RNA是无法被RNA连接酶连接,因而无法进入下一步的测序实验;对测序数据进行深入地比对分析,可以直观地发现在mRNA序列的某个位点会出现一个波峰,而该处正是候选的miRNA剪切位点。利用降解组测序,可以真正从实验中找到miRNA的作用靶基因。传统预测miRNA靶标的方式主要是依靠计算机模拟后进行验证,假阳性的发生率极高。随着高通量测序的发展,直接测序得到mRNA的降解片段,通过后续的信息分析,不仅能够准确分析小RNA及靶基因,还能发现新的小RNA。


    数据分析

    标准数据分析

    1、 数据初步过滤及质量统计

    2、 序列二次过滤

    3、 鉴定mRNA降解片段


    高级数据分析

    1、 鉴定与mRNA降解相关的miRNA

    2、 剪切位点可靠性分群

    3、 miRNA与靶基因的配对位点描述

    4、  剪切位点可靠性分析

    5、  新靶基因的功能富集分析

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