外泌体广泛存在于细胞上清与外周血、尿液、腹水等体液中，可来自各种类型细胞。外泌体的内容物含蛋白质、脂质和核酸等，外泌体的脂膜包裹和保护，使得内容物可以保持其原有稳定性和生物学功能。外泌体RNA特别是非编码RNA，在不同的疾病模型中存在明显的表达差异，有望成为液体活检的重要分子标志物，并揭示疾病发生的机理。利用高通量转录组测序技术可以同时检测其所含RNA分子如lncRNA，mRNA，对外泌体mRNA、lncRNA等的鉴定和调控功能进行研究。
服务优势
1、专利外泌体抽提技术，配合特有微量RNA建库方法，提供lncRNA测序整体服务
2、采用3个外泌体或囊泡数据库，注释信息更完善，为深入挖掘结果提供佐证
3、多种差异表达计算方法，可根据项目情况灵活选择算法，展现更完美的数据
4、全新的比对软件，分析速度更快，结果更准确
5、提供肿瘤研究的临床数据分析，使得分析结果更加饱满。
代表性客户文章
- Wu Q, Wang J, Tan W L W, et al. Extracellular vesicles from human embryonic stem cell-derived cardiovascular progenitor cells promote cardiac infarct healing through reducing cardiomyocyte death and promoting angiogenesis[J]. Cell death & disease, 2020, 11(5): 1-16.
- Guo N, Zhou Q, Huang X, et al. Identification of differentially expressed circulating exosomal lncRNAs in IgA nephropathy patients[J]. BMC immunology, 2020, 21(1): 1-9.
外泌体研究全面技术路线
高通量测序与分析流程
生物信息学分析项目
| 测序类型 | 基本分析 | 高级分析 |
|---|---|---|
| 外泌体lncRNA测序 | 数据质量评估及QC 核糖体RNA去除率计算 参考基因组比对与全基因组reads分布图谱 基因表达量整体水平 样品（组）间基因表达差异分析 差异基因KEGG生物通路富集分析 差异基因 Gene Ontology （GO）功能富集分析 转录本表达量整体水平 已知mRNA表达量 已知mRNA表达差异分析 已知ncRNA表达量 已知ncRNA表达量差异分析 哺乳动物已知ncRNA保守性分析 · 近缘物种的保守性分析 · Phylop保守性分析 SNP和InDel检测及注释 样品间相关性分析 样品间主成分分析 时间序列分析（与分析5二选一） 以下限50条序列分析（仅限于人、大鼠、小鼠物种） lncRNA靶基因预测 lncRNA与靶基因互作分析 lncRNA靶基因KEGG生物通路富集分析 lncRNA靶基因Gene Ontology （GO）功能富集分析 | 1、共表达分析（样品>=10） 2、lncRNA Disease注释 3、肿瘤药物注释 3.1 肿瘤耐药基因注释 3.2肿瘤靶向药物注释 4、基因融合分析 5、可变剪切分析（rMATs） 6、lncRNA-miRNA互作分析 7、基因富集分析（GSEA） （每组至少3个生物学重复样品） 8、加权基因共表达网络分析 （WGCNA）（加权基因共 表达网络分析，样品>=10） 9、RNA结合蛋白预测 10、已知lncRNA甲基化注释 11、eRNA分析 12、外泌体特有基因注释 |
常见问题
1.锐博生物提供exosomes中lncRNA测序和分析的同时，是否提供exosomes提取服务，对样品有何要求？
利用自主研发的RiboTM Exosome Isolation Reagent提取试剂盒，锐博可提供人、大小鼠细胞上清、血清、血浆及其他体液的exosomes提取服务，通过大量实验验证，使用RiboTM Exosome Isolation Reagent可高效提取结构和功能完整的exosomes，产物可用于NGS、细胞共培养以及体内注射等后续功能实验。
2.细胞培养状态是否会影响外泌体的测序分析结果？
会，不同培养条件的细胞分泌的外泌体量不同；在细胞凋亡的过程中，会释放大量的凋亡小体和细胞碎片，凋亡小体也是囊泡状结构，在外泌体分离时难以排除凋亡小体，从而影响测序数据。
3.送样要求有哪些要求？
