高通量测序样品质检标准及运输建议
客户自行提取DNA/RNA的样品要求符合锐博提取样品的质检标准;非特殊情况下,客户提供质检信息的样品,接收后都要再次质检,确认样品质量没有在运输过程受影响。
1.1 DNA样品要求
接收样品前要求客户分装备份,用于样品检测不合格时分析原因。表3列出了DNA 样品所需质量标准。
表1. DNA 样品质量标准
检测标准说明:
1) 上表中对样品DNA总量(m)的要求主要针对人、鼠来源的样品。对于其他来源的样品,建议以更高的质量要求进行送样。
2) 浓度、总量,纯度参考K5500检测OD值。
3) 等级A为满足两次及两次以上建库的样品标准,等级B为满足一次建库的样品标准。为了保障项目的顺利进行,推荐按照等级A标准进行送样。
4) 如果样品无法满足等级A或B中的任何一项指标,同时由于特殊原因无法再准备更多样品,可根据实际情况进行风险建库测序,但不保证测序质量。
5) 如有任何问题,请在送样前咨询销售代表或技术支持。
1.2 RNA样品要求
接收样品前:要求客户分装备份,用于样品检测不合格时分析原因。
运输RNA样品时:将溶解好的RNA转至-80℃保存,干冰运输。
表2列出了RNA样品所需质量标准。
表2. RNA 样品质量标准
检测标准说明:
1) 上表中对样品RNA总量(m)的要求主要针对人、鼠来源的样品。对于其他来源的样品,建议以更高的质量要求进行送样。
2) 纯度参考K5500检测OD值,浓度参考K5500或Qubit检测结果。
3) 等级A为满足两次及两次以上建库的样品标准,等级B为满足一次建库的样品标准。为了保障项目的顺利进行,推荐按照等级A标准进行送样。
4) 如样品无法满足等级A或等级B中的任何一项指标,同时由于特殊原因无法再准备更多样品,可根据实际情况进行风险建库测序,但不保证测序质量。
5) 如有任何问题,请在送样前咨询销售代表或技术支持。
6) MeRIP实验获得的RNA进行后续建库测序均为风险建库。
1.3 自建库样品准备建议
表3. 客户自建库建议样品质量标准
注:
1) 如客户使用试剂盒进行文库构建,需提供试剂盒的详细信息(最好提供一份建库时所使用的核酸序列的电子文档供参考),以及每个文库的index编号和序列;
2) 如客户不是使用商品化试剂盒进行文库构建,需要提供建库流程的详细信息(尤其是adapter和PCR primer序列),以及每个文库的index编号和序列。