Long noncoding RNA TLNC1 promotes the growth and metastasis of liver cancer via inhibition of p53 signaling
长链非编码RNA TLNC1通过抑制p53信号促进肝癌的生长和转移
发表期刊：Mol Cancer
影响因子：27.401
发表时间：2022年4月27日
背景：长链非编码RNAs（lncRNAs）已被证明在癌症发展和进展中发挥重要作用。然而，它们在肝癌中的生物学作用和功能机制在很大程度上仍然未知。
结果：基于RNA-seq、TCGA RNA-seq和TCGA生存分析数据的交集，本研究将TLNC1鉴定为肝癌的潜在致瘤lncRNA。TLNC1在体内外均显著促进肝癌细胞的生长和转移。TLNC1发挥其致瘤作用是通过与TPR相互作用并诱导TPR介导的p53从细胞核到细胞质的转运，从而抑制p53靶基因的转录，最终促进肝癌的进展。
结论：TLNC1是一种很有前景的肝癌预后因子，TLNC1-TPR-p53轴可作为肝癌治疗的潜在治疗靶点。
Fig1. TLNC1在调节p53信号通路中的功能示意图
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35477447/
Urinary extracellular vesicles contain mature transcriptome enriched in circular and long noncoding RNAs with functional significance in prostate cancer
尿细胞外囊泡包含成熟的转录组，富含在前列腺癌中具有重要功能意义的环状和长链非编码RNAs
发表期刊：J Extracell Vesicles
影响因子：25.841
发表时间：2022年5月8日
长链非编码（lnc）RNAs调节基因表达，同时呈现出意想不到的新抗原来源。尽管他们有巨大的利益，但他们转移和控制相邻细胞的能力尚不清楚。细胞外囊泡（EVs）为核酸提供保护环境，通过控制免疫反应具有促肿瘤和抗肿瘤功能。与细胞外非囊泡RNA相比，很少有研究涉及人类体液EVs中的全部RNA内含物，并将其与它们的起源组织进行比较。本研究对6个福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）前列腺癌（PCa）肿瘤组织及其配对的尿液（u）EVs进行了总RNA测序，以提供来自同一患者的第一个全转录组比较。UEVs包含有无内含子的细胞质转录本和丰富的lnc/环状（circ）RNAs的简化转录组，这在独立的20例患者的泌尿队列中非常常见。研究人员对三个PCa细胞系中的完整细胞和EVs转录组进行了比较，鉴定了一组重叠的14个uEV-circRNAs，这些uEV-circRNAs被表征为体外前列腺细胞增殖所必需的，以及属于CLC2（Cancer-related LncRNA Census）的28个uEV-lncRNAs。此外，本研究发现了15个uEV-lncRNAs，预测编码768种高亲和力新抗原，通过质谱分析发现其中3个编码的ORF产生了可检测到的未修饰多肽。本研究对尿液和体外EVs中EVs-lnc/circRNAs的双重分析为未来涉及PCa的uEV-lnc/circRNAs表型表征提供了基础资源。
Fig2. uEVs富集的RNAs显示lncRNA编码的新抗原被前列腺细胞系共享
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35527349/
LncRNA-PACERR induces pro-tumour macrophages via interacting with miR-671-3p and m6A-reader IGF2BP2 in pancreatic ductal adenocarcinoma
LncRNA-PACERR通过与miR-671-3p和m6A-reader IGF2BP2相互作用诱导胰腺导管腺癌中的促肿瘤巨噬细胞
发表期刊：J Hematol Oncol
影响因子：17.388
发表时间：2022年5月7日
背景：LncRNA-PACERR在组织相关巨噬细胞（TAMs）的极化中起着关键作用。在本研究中，研究人员发现了PACERR在TAMs中调节胰腺导管腺癌（PDAC）进展的功能和分子机制。
结果：LncRNA-PACERR在TAMs中高表达，与PDAC患者的不良预后相关。本研究发现验证了LncRNA-PACERR增加了M2极化细胞的数量，并在体外和体内促进了细胞的增殖、侵袭和迁移。机制上，LncRNA-PACERR通过与miR-671-3p结合激活KLF12/p-AKT/c-myc通路。而与IGF2BP2结合的LncRNA-PACERR以m6A依赖性方式增强了KLF12和c-myc在细胞质中的稳定性。此外，LncRNA-PACERR的启动子是KLF12的靶标，LncRNA-PACERR通过在细胞核中与KLF12相互作用，募集EP300以增加组蛋白的乙酰化。
结论：本研究发现LncRNA-PACERR作为PDAC微环境中TAMs的关键调节因子，揭示了细胞质和细胞核中的新机制。
Fig3. 模型图展示了TAMs中LncRNA-PACERR和KLF12之间的正反馈回路，以促进PDAC中的增殖和迁移
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35526050/
Enhancer RNAs stimulate Pol II pause release by harnessing multivalent interactions to NELF
增强子RNAs通过利用与NELF的多价相互作用来刺激Pol II暂停释放
发表期刊：Nat Commun
影响因子：14.919
发表时间：2022年5月4日
增强子RNAs（eRNAs）是源自增强子的长链非编码RNAs。尽管eRNA转录是激活增强子的典型特征，但eRNA功能所需的分子特征以及eRNAs如何影响靶基因转录的机制尚未确定。因此，本研究使用eRNA依赖性RNA聚合酶II（Pol II）暂停释放作为模型，研究了eRNAs的序列、结构和长度对它们通过从暂停的Pol II中分离NELF来刺激Pol II暂停释放能力的要求。研究发现eRNA并非通过常见的结构或序列基序发挥其功能。相反，长度大于200个核苷酸且包含未配对鸟苷的eRNAs与NELF亚基-A和-E进行多次变构接触，以触发有效的NELF释放。通过揭示eRNA功能的分子决定因素，本研究证实了eRNAs在Pol II暂停释放中发挥了重要作用，并为研究后生动物转录的调控提供了新的见解。
Fig4. eRNA和暂停延伸复合物（PEC）之间的多价变构相互作用刺激Pol II暂停释放模型示意图
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35508485/
Copy number amplification and SP1-activated lncRNA MELTF-AS1 regulates tumorigenesis by driving phase separation of YBX1 to activate ANXA8 in non-small cell lung cancer
拷贝数扩增和SP1激活的lncRNA MELTF-AS1通过驱动YBX1的相分离激活非小细胞肺癌中的ANXA8来调节肿瘤发生
发表期刊：Oncogene
影响因子：9.867
发表时间：2022年5月4日
据报道，长链非编码RNAs（lncRNAs）在肿瘤发生中起着关键作用。然而，lncRNA介导的RNA结合蛋白相分离在肿瘤发生中的调控机制尚未完全阐明。本研究通过系统的数据分析、筛选和验证，鉴定出一个致癌lncRNA MELTF-AS1。MELTF-AS1在非小细胞肺癌（NSCLC）中显著上调。高MELTF-AS1水平与晚期肿瘤-淋巴结转移期（TNM）、高肿瘤大小和生存时间缩短相关。功能上，MELTF-AS1在体外和体内调节细胞增殖和转移。RNA测序分析显示，MELTF-AS1敲低特异性调节了与细胞增殖、凋亡和迁移相关的基因。机制研究发现，在基因组水平上，拷贝数扩增促进了MELTF-AS1的表达。在转录水平上，转录因子SP1通过与其启动子结合直接激活MELTF-AS1的转录。此外，MELTF-AS1可以直接结合并驱动YBX1（YBX1是一种RNA结合蛋白，参与肿瘤发生）的相分离，从而激活ANXA8转录，促进NSCLC的肿瘤发生。已在多种肿瘤中发现了ANXA8的异常激活和促进肿瘤发生。这些新发现证明了MELTF-AS1驱动的相分离介导的转录调控的关键作用，并为NSCLC提供了一个潜在的新型诊断和治疗靶点。
Fig5. MELTF-AS1介导的NSCLC增殖和转移模型
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35508543/
